لدى الجمعية بفرع المنيا مركز طبي تم إنشاؤه بإهداء من الأفاضل العاملين بالهيئة العامة للاستثمار بنظام الوقف الخيري لهم .

يضمن المركز عيادات للأسنان والنساء والباطنة والعظام والقلب والأنف والأذن ومعمل للتحاليل.

يقدم المركز خدماته بسعر رمزي للقادرين ومجانًا لغير القادرين.

كما يتم تنفيذ العديد من القوافل الطبية بالمركز بالتعاون مع أطباء أو مؤسسات أهلية شريكة.